Caracterización de los genomas mitocondriales de reptiles y evolución del género Erythrolamprus (Serpentes: Dipsadidae) mediante el uso de codones
...
Montaña Lozano, Paula | 2023-08-29
spa:El estudio de genomas mitocondriales en reptiles ha sido relevante debido a su papel en el metabolismo y su uso como herramienta para estudiar diferentes procesos evolutivos. El sesgo de codones presente en los genes mitocondriales varía entre especies y se considera como una ventaja evolutiva debido a que influye en la transcripción, estabilidad del ARNm y modificación postraduccional de proteínas. Sin embargo, a la fecha no se ha realizado un macro-análisis de la composición nucleotídica y patrones de uso de codones a diferentes niveles taxonómicos de reptiles relacionando estas características con estilos de vida. Por lo anterior, se realizó una detallada caracterización de los genomas mitocondriales de 400 especies de reptiles disponibles en la base de datos Refseq del NCBI, el cual permitió determinar diferentes patrones de sesgo composicional y uso de codones diferencial entre los grupos analizados que podrían estar relacionados con adaptaciones metabólicas como la tolerancia a condiciones anóxicas en tortugas y aclimatación al frío en cocodrilos. En este trabajo se obtuvieron 28 nuevos mitogenomas de géneros de serpientes poco estudiados del neotrópico, los cuales fueron obtenidos mediante secuenciación y ensamblaje de genomas mitocondriales a partir de transcriptomas. Además, se realizó un análisis comparativo más detallado enfocado en la familia Dipsadidae y en el género Erythrolamprus, considerando la ventaja selectiva que representan los patrones de coloración miméticos de algunas especies del género evaluado. Los resultados sugieren patrones de composición nucleotídica y sesgo de codones diferencial de las especies de Erythrolamprus. respecto a otras especies de la familia. Además, se determinó que las especies con mimetismo poseen en algunos genes mitocondriales una mayor magnitud de presión selectiva. Este trabajo propone una metodología para estudiar las diferentes características en los mitogenomas de un grupo taxonómica y evolutivamente diverso, además de evidenciar las presiones selectivas de un proceso complejo como el mimetismo.
LEER