Farmacogenética aplicada al análisis del citocromo cyp3a89 en equinos criollos colombianos del suroeste antioqueño
Trabajo de grado - Maestría
2022-11-29
spa:El caballo más representativo para Colombia es criollo, un animal que se ha adaptado ambiental y culturalmente al país y que ha sido sometido a un proceso de selección por años de interacción con el hombre, participando con un papel protagónico en labores de recreación, deporte y trabajo. Sin embargo, desde la medicina veterinaria, la farmacología en esta población de equinos se entiende de manera incompleta, debido al desconocimiento de los genes que codifican para los citocromos, enzimas que son responsables del metabolismo de una proporción importante de fármacos en equinos. Consecuentes con la responsabilidad de promover el bienestar animal desde la perspectiva de la intervención con fármacos, así que es importante conocer hasta donde sea posible las características de los grupos de individuos. Dentro de los genes responsables del metabolismo de fármacos en equinos se consideró la familia de genes codificantes para citocromos P450. En esta investigación se ha hecho un recuento de estudios en diferentes razas de equinos y se han aplicado técnicas de bioinformática y de biología molecular para confrontar la información publicada, con una muestra de 5 caballos y 5 yeguas criollos del suroeste de Antioquia, en Colombia. Con el objetivo de describir algunas características del gen CYP3A89 en equinos criollos colombianos y su potencial impacto en la actividad metabólica del citocromo; comparando así mismo, los hallazgos con los reportes de otras líneas genéticas. Con el gen CYP3A89 seleccionado, se hizo un ejercicio de análisis hasta determinar las regiones de interés y se decidió amplificar y secuenciar seis regiones dentro del gen, correspondientes a los sitios de reconocimiento de sustratos, sitios que son determinantes para el reconocimiento y unión de sustratos. Proceso que requirió iniciar por diseñar los juegos de cebadores específicos con la información del genoma equino disponible y una herramienta de PCR in sillico, posteriormente con los productos de la PCR de punto final, se hizo el proceso de secuenciación de las seis regiones, en un subgrupo de tres animales. Los resultados de la secuenciación muestran que las regiones específicas que codifican para los sitios de reconocimiento de sustratos se han conservado y en la muestra revisada no hubo sustituciones, inserciones o deleciones que puedan alterar la forma o la función de la proteína. Demostrando que son regiones altamente conservadas y que, aunque es muy probable las variaciones interespecie, probablemente por la limitación de la muestra, no se evidenciaron. Esto genera un precedente pues es una población con la que antes no se ha hecho investigación en la rama de la farmacogenética. Así que este tipo de estudios servirán para el análisis de variantes genéticas con fines clínicos, que posteriormente permitirán predecir los fenotipos de los pacientes en medicina veterinaria, hasta lograr hacer un abordaje individualizado. eng:The most representative horse for Colombia is creole, an animal that has adapted environmentally and culturally to the country and has undergone a selection process for years of interaction with man, participating with a leading role in recreation, sports and work. However, from veterinary medicine, the pharmacology in this population of equines is incompletely understood, due to the lack of knowledge about the genes that code for cytochromes, enzymes that are responsible for the metabolism of a significant proportion of drugs in equines. Consistent with the responsibility of promoting animal welfare from the perspective of drug intervention, we consider it important to seek to know as far as possible the characteristics of groups of individuals. In this research, a recount of studies in different equine breeds has been made and bioinformatics and molecular biology techniques have been applied to confront the published information, with a sample of five creole horses and five creole mares from the southwest of Antioquia, in Colombia. With the aim of describing some characteristics of the CYP3A89 gene in Colombian Creole equines and its potential impact on cytochrome metabolic activity, comparing the findings with reports of other genetic lines. With the CYP3A89 gene selected, an analysis exercise was carried out until the regions of interest were determined and six regions within the gene were amplified and sequenced, corresponding to the substrate recognition sites, sites that are decisive for the recognition and binding of substrates. This process required starting by designing the specific primer sets using the equine genome information available and an in silico PCR tool, afterwards with the endpoint PCR products, the sequencing process of the six regions was carried out, in a subgroup of three animals. The sequencing results show that the specific regions encoding the substrate recognition sites have been conserved and there were no substitutions, insertions or deletions in the reviewed sample that could alter the protein shape or function. Demonstrating that they are highly conserved regions and that, although interspecies variations are very likely, probably due to the limitation of the sample, they were not evidenced. This creates a precedent because it’s a population with which no research has been done before in the field of pharmacogenetics. So this type of study will continue to analyze genetic variants for clinical purposes, which will later allow predicting the phenotypes of patients in veterinary medicine, until an individualized approach is achieved.
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LauraAndrea_CaicedoGutiérrezdePiñeres_2022
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